Com a criação de Água Boa, no início do ano de 1975, e seu enorme crescimento não foi mais possível o atendimento, por parte dos religiosos Salesianos do então distrito de Xavantina, diante disso no ano de 1978, foi fundada a comunidade de Nossa Senhora Aparecida, que se tornou a Padroeira de Água Boa.

Como surgiu o nome da Comunidade Nossa Senhora Aparecida? Foi em uma das viagens, durante a celebração Eucarística, no pavilhão comunitário, que o padre Arantes do Nascimento, Sacerdote Salesiano da Comunidade de Xavantina, hoje Nova Xavantina, sugeriu este nome, dizendo que uma Igreja deveria ter o nome da Mãe de Nosso Senhor Jesus Cristo, e que se a Comunidade aceitasse Nossa Senhora Aparecida, ele próprio doaria a imagem, por ser devoto da santa. A proposta foi aceita por todos os integrantes desta Nova Comunidade.

Como a Imagem da padroeira Nossa Senhora de Aparecida chegou aqui em Água Boa? Veio trazida por meio de transporte rodoviário (automóvel), até chegar à localidade conhecida como “Gaucho”, a mais ou menos 18 quilômetros de Água Boa, sendo o restante percorrido em cima de um trator, acompanhada por uma numerosa procissão de tratores, carros e caminhões, por ser esta região extremamente agrícola. No começo, as celebrações eram realizadas na escola, após no pavilhão comunitário que foi construído pela comunidade Católica e Luterana.

No início de 1980 foi obtida junto à Colonizadora uma quadra para a edificação da Igreja Matriz Nossa Senhora Aparecida. Logo, foi lançada a pedra fundamental da nova igreja. Muito trabalho e diversas campanhas de doações, e o trabalho das diretorias da igreja, juntamente com o esforço de todos os paroquianos deram o início à obra. Na época a comunidade era atendida por padres da região.

No ano de 1984, a comunidade conseguiu erguer as paredes da igreja e teve um padre por alguns meses, de nome Mauro. No ano de 1985 foi colocado o telhado e a comunidade foi atendida, por um curto período de tempo, pelo padre Antonio Ângelo Dal Piva, vindo da Diocese de Frederico Westfhalen-RS. No final de setembro de 1986, a comunidade conseguiu, através de mutirão, concluir o contra piso da igreja, quando então começaram as celebrações Eucarísticas, no dia da Padroeira em 12 de Outubro de 1986. Em seguida foram colocadas as portas para que pudesse ser colocado o Santíssimo Sacramento no sacrário. Em 1988, foi feito uma campanha para colocar as janelas e os respectivos vidros, e veio para Água Boa, da Diocese de São José do Rio Preto – SP, o padre Celso, que permaneceu aqui por aproximadamente um ano.

O padre José Aparecido Sioffi veio logo em seguida, ficando em Água Boa até o ano de 1993. Nesse período a Comunidade conseguiu recursos para colocar o piso definitivo, bem como para construir o presbitério e o altar da Igreja. Em 1994 vieram para Água Boa o Pe. Silvério e o Pe. Sérgio, da Diocese de Frederico Westhfalen-RS, os quais permaneceram nesta cidade por seis meses, quando então veio o Padre Valdemar Barbosa, vindo da Diocese de São Luiz De Montes Belos-GO. Este padre ficou em Água Boa 18 meses, sendo que neste período a comunidade conseguiu terminar a construção da Igreja Matriz com a colocação do forro, bancos, pintura bem como do ajardinamento e da Cruz, sinal de todo Cristão, localizado em frente, ao lado direito da Igreja, edificada em forma de torre no jardim. Em 1995, voltou de Roma, onde fora aperfeiçoar seus estudos, o padre José Sioffi, que ficou por um curto período, sendo substituído, em fevereiro de 1996, pelo padre João Kolling, cedido da Comunidade de General Carneiro-MT, por seis meses quando veio para Água Boa o Pe. Clever Morato da Diocese de São Luiz de Montes Belos-GO, permanecendo nesta Comunidade até o início de março de 1997, quando assumiu esta Paróquia a Congregação dos padres Servos da Caridade, com a vinda do Pe. Adenir José Fumagalli, no dia 09 de março do mesmo ano, permanecendo até fevereiro de 2007 quando tomou posse o Pe. Irani José Villani.

Também trabalharam em nossa Paróquia os Padres da Congregação Servos da Caridade: Pe. Armando Bredice, Pe. Gaetano Chinaglia e Pe. Odair Danieli.

Em 11 de fevereiro de 1987, vieram para Água Boa, às irmãs do Instituto Jesus Maria e José, as quais se estabeleceram em uma casa construída no pátio da Igreja, pertencente a Comunidade e no ano de 1993, edificaram sua própria residência, na Rua 12 esquina com rua 9, em uma quadra obtida junto a prefeitura municipal onde também edificaram a Escola Sagrada Família, atualmente Colégio Jesus Maria José.

No início dos anos 90 estabeleceram-se em Água Boa os Irmãos da Congregação Sagrada Família, que em princípio residiram na residência da Comunidade Nossa Senhora Aparecida, onde anteriormente residiram as Irmãs, e posteriormente adquiriram uma residência na Rua 06 esquina com Rua Baru no Bairro de Vila Nova. Os irmãos exerceram suas atividades educacionais junto as escolas municipais dos Bairros Vila Nova, Guarujá e Cristalino, e trabalharam em diversas atividades pastorais na Igreja São José, Bairro Operário/Vila Nova, Bom Jesus no Bairro Guarujá, e Mãe de Deus no Bairro Cristalino, nesta Cidade.

Seguem os nomes das pessoas que presidiram a comunidade: Bruno Nereu Petters, Armando Didonet, Ângelo Zandoná, Ermelindo José Stein, Jolmir Antoninho Pezzini, Raimundo José Klein, Délcio Rorato, Jorge Alberto Wietheuper, Eugênio Mário Possamai, Pedro Bonetti, Valmor Bernieri, Valmor Casanova, Danilo de Mello.

No ano de 2007 foi formado o CPP(Conselho Paroquial Pastoral) tendo como Coordenadores Jorge Alberto Wietheuper e Earle Francisco da Silva.

A Igreja Matriz Nossa Senhora Aparecida é formada por vinte e nove comunidades (capelas) sendo que uma das maiores dificuldades a distância das Comunidades com a Matriz, que em alguns casos chega a cento e oitenta quilômetros, como é o caso da comunidade São Sebastião de Cocalinho. A infra estrutura ainda é precária, com rodovias que ficam praticamente intransitáveis no período chuvoso.